Vamos preparar seu Ubuntu para obter os pacotes necessários a disciplina e também as instalações dos pacotes que te interessar, boas instalações!

1) Clique em Aplicações -> Acessórios -> Terminal e na linha de comando execute:

sudo gedit /etc/apt/sources.list

2) Substitua o texto que estiver lá pelo seguinte:

a) Caso sua distribuição seja a versão dapper 6.06 LTS.

 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu dapper main restricted universe multiverse
 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu dapper-updates main restricted universe multiverse
 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu dapper-security main restricted universe multiverse

b) Caso sua distribuição seja a versão edgy 6.10.

 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu edgy main restricted universe multiverse
 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu edgy-updates main restricted universe multiverse
 deb http://espelhos.edugraf.ufsc.br/ubuntu edgy-security main restricted universe multiverse      

3) Salve o arquivo que você editou e feche o Gedit.

4) Abrindo novamente o terminal execute :

sudo apt-get update

Agora você já pode instalar o Java e outros pacotes de seu interesse sem problemas.